鸿运国际制藥片劑、膠囊劑、顆粒劑生產線于2001年首次率先通過國家食品藥品監督管理局GMP認證，于2006年順利通過5年到期GMP復查認證，并于2011年順利通過2010版GMP認證、2017年順利通過2010版GMP五年到期認證。該三條生產線嚴格按照口服固體制劑的工藝流程和D級潔凈區設計、建設；設備先進、自動化程度搞，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的"四化生產",能有效地保證產品質量，其中，超微低溫粉碎機、高效濕法制粒機、高效沸騰制粒機、真空回轉干燥機、全自動無塵壓片機、全自動顆粒包裝機、自動鋁塑包裝機、自動雙鋁包裝機和全自動瓶裝生產線均屬國際國內領先設備。超微低溫粉碎技術的應用，提高了溶出效果和生物利用度，使產品質量有了質的飛躍。生產車間的各類驗證、日常監控均嚴格按規定實施，有效保證生產線生產出的產品穩定、均一、可控。

鸿运国际制藥膠囊劑、散劑生產線于2004年首次通過國家食品藥品監督管理局GMP認證，軟膠囊生產線當時填補了重慶市軟膠囊生產線空白。該兩條生產線于2009年順利通過5年到期GMP復查認證，2014年順利通過2010版GMP認證。該兩條生產線嚴格按照口服固體制劑的工藝流程和D級潔凈區設計、建設；設備先進、自動化程度搞，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的"四化生產",有效地保證產品質量，其中，全自動壓丸機、自動鋁塑包裝機、全自動瓶裝生產線、低溫粉碎設備、全自動低溫顆粒包裝機均屬國際國內領先設備。車間的各類驗證、日常監控均嚴格按規定實施，有效保證生產線生產出的產品穩定、均一、可控。

鸿运国际制藥粉針劑、凍干粉針劑和小容量注射劑生產線于2004年首次通過國家食品藥品監督管理局GMP認證，于2009年順利通過5年到期GMP復查認證，2013年順利通過2010版GMP認證，該三條生產線嚴格按照無菌制劑的工藝流程和A、B、C、D級潔凈區設計，與藥品直接接觸的容器具、膠塞、玻瓶等暴露區域全部在FFU保護下，有效防止了污染和交叉污染；設備先進、自動化程度高，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的"四化生產",有效地保證產品質量。其中，配料系統、全自動超聲波洗瓶機、全自動膠塞清洗機、全自動無菌分裝機、全自動無菌灌裝半壓塞機、真空冷凍干燥機、全自動拉絲灌封機、全自動水浴滅菌檢漏設備等均屬國際國內領先設備。各生產線的各類驗證、日常監控均嚴格按規定實施，有效保證生產線生產出的產品穩定、均一、可控。

鸿运国际制藥中藥提取生產線是"國家中藥現代化工程技術中心""重慶市現代中藥制藥工程技術研究中心"，于2001年首次率先通過國家食品藥品監督管理局GMP認證，于2006年順利通過5年到期GMP復查認證，并于2011年順利通過2010版GMP認證、2017年順利通過2010版GMP五年到期認證，該生產線嚴格按照口服固體制劑的工藝流程和D級潔凈區設計、建設；設備先進、自動化程度高，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的"四化生產"，能有效地保證產品質量，該生產線年生產能力1000噸。整車間的各類驗證、日常監控均嚴格按規定實施，有效保證生產線生產出的產品穩定、均一、可控。新建五期生產線將全面實現生產自動化。

鸿运国际制藥化學原料藥生產線于2001年首次率先通過國家食品藥品監督管理局GMP認證，于2006年順利通過5年到期GMP復查認證，并于2011年順利通過2010版GMP認證、2017年順利通過2010版GMP五年到期認證，2020年增加了二期合成生產線，使得我公司鋁碳酸鎂原料藥產能在原有的基礎上擴大3倍；該生產線嚴格按照口服制劑（原料藥）的工藝流程和D級潔凈區設計、建設；設備先進、自動化程度高，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的"四化生產",能有效地保證產品質量，其中，超微低溫粉碎機、高效沸騰干燥機等均屬國際國內領先設備。超微低溫粉碎技術的應用，提高了溶出效果和生物利用度，使產品質量有了質的飛躍。整車間的各類驗證、日常監控均嚴格按規定實施，有效保證生產線生產出的產品穩定、均一、可控。

鸿运国际制藥合成生產線于2012年新建而成，并于2017年順利通過2010版GMP認證。該生產線主要用于新研發的高新科技原料藥生產，嚴格參照口服制劑（原料藥）的相關要求及D級潔凈區設計、建設，整個過程融入國際先進理念，生產設備先進、操作自動化程度高，真正實現生產操作程控化、物料輸送管道化、產品檢測自動化的全新高效化生產。整個生產線日常管理嚴格參照2010版GMP執行，讓新藥的研究過程更具科學性、可控化，使之著實成為鸿运国际制藥未來騰飛的翅膀。

       502車間為無菌制劑車間，現有凍干粉針劑、粉針劑兩條生產線，建筑總面積為16000 ㎡，車間布局嚴格按照無菌制劑的工藝流程和A、B、C、D級潔凈區設計，膠塞實現與灌裝系統管道輸送膠塞，配液、灌裝系統均采用全自動在線CIP、SIP，隧道烘箱冷卻段進行高溫滅菌，B級區空間采用空調送風系統進行過氧化氫滅菌，灌裝及自動進出料系統均采用ORABS系統，有效防止了污染和交叉污染；設備先進、自動化程度高，真正實現生產程控化、輸送管道化、檢測自動化、包裝機械化的“四化生產”,有效地保證產品質量。其中，車間配有全自動配料系統、全自動超聲波洗瓶機、全自動膠塞清洗機、全自動無菌分裝機、全自動無菌灌裝機、全自動真空冷凍干燥機、汽化過氧化氫無菌傳遞窗、空調過氧化氫滅菌系統、凍干機固定式自動進出料系統、四工位半自動燈檢機、立式圓瓶高速貼標機、西林瓶包裝自動生產線、全自動裝箱碼垛機等設備均屬國際國內領先設備。

      503車間為口服固體制劑車間，建筑總面積有19291㎡，共有3層樓，6條生產線。其中一樓為硬膠囊劑、散劑、顆粒劑生產線，二樓為軟膠囊及滴劑（膠囊型）生產線，三樓為片劑生產線。產品生產實現了全自動連線生產，車間配備了從內包裝到外包裝聯動生產線，外包裝采用機器人自動裝箱碼垛，提高了生產效率降低了勞動強度，潔凈區配備了自動化、智能化程度較高的AGV小車（自動轉運車），可自動轉運物料。全自動控制的純化水系統，每小時產水量6T，充分保障車間用水供應，并配備了先進的EDI系統，使純化水質量得到充分的保障。空調系統擁有先進的BMS、EMS系統，自動控制模式下，能自動實現對HVAC系統的控制，以達到要求的潔凈區溫度、濕度、風量和壓差范圍。

中藥前處理及提取生產線（中藥前處理及提取生產線）共四層，為甲類廠房，耐火等級一級，建筑面積：10268.94m2。一層主要為收膏潔凈區；二層主要生產工序為提取醇沉、藥液靜置、過濾；三層主要生產工序為提取、超臨界二氧化碳萃取及輔助機房、庫房；四層為藥材前處理各工序、提取稱量備料及投料。配備有選洗切一體的全自動中藥前處理生產線；有16臺套自動投料、提取、濃縮設備，全自動提取濃縮控制系統，尾氣處理系統、熱力站、真空帶式干燥機等，中藥前處理設備先進、自動化程度高，真正意義實現了中藥提取的生產程控化、輸送管道化。

于2022年建成西南地區首條特醫食品生產線，生產線嚴格按照國際標準建造，符合特醫食品GMP標準要求，實行信息化、自動化生產，實現從原料到成品全流程的質量控制。車間配有多型號的混合篩分設備，以滿足產品的多樣化生產需求，同時配置了完善的充氮裝置，對生產過程進行充氮保護，以有效保證特醫產品質量。